案例：某個人合伙企業是一家小水電企業，因國家政策將小水電予以關閉，經評估公司評估后和當地政府達成如下協議：（1）取得一次性搬遷補償款400余萬元；（2）一次性取得停產停業補償款50余萬元。合伙企業取得的補償是否納稅？
一、增值稅方面。根據《財政部 稅務總局關于明確無償轉讓股票等增值稅政策的公告》(財政部 稅務總局公告2020年第40號)第三規定：土地所有者依法征收土地，并向土地使用者支付土地及其相關有形動產、不動產補償費的行為，屬于《營業稅改征增值稅試點過渡政策的規定》(財稅〔2016〕36號印發)第一條第(三十七)項規定的土地使用者將土地使用權歸還給土地所有者的情形。《財政部 國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）（附件3：營業稅改征增值稅試點過渡政策的規定）第一條第規定，下列項目免征增值稅：…（三十七）土地所有者出讓土地使用權和土地使用者將土地使用權歸還給土地所有者。因此，合伙企業收到的搬遷補償收入，包括的土地補償、地上建筑物補償、機器設備補償，屬于將土地使用權歸還給土地所有者而取得的收入，免征增值稅。
注意：企業享受免征增值稅時應提供的文件：納稅人享受土地使用權補償收入免征增值稅政策時，需要出具縣級（含）以上地方人民政府收回土地使用權的正式文件，包括縣級（含）以上地方人民政府出具的收回土地使用權文件以及土地管理部門報經縣級以上（含）地方人民政府同意后由該土地管理部門出具的收回土地使用權文件。
企業在搬遷過程中因搬遷、安置而給予的補償；對停產停業形成的損失而給予的補償；資產搬遷過程中遭到毀損而取得的保險賠款和其他補償收入，因為并未發生應稅行為，所以也不存在繳納增值稅。并且《國家稅務總局關于取消增值稅扣稅憑證認證確認期限等增值稅征管問題的公告》（國家稅務總局公告2019年第45號）明確規定，納稅人取得的財政補貼收入，與其銷售貨物、勞務、服務、無形資產、不動產的收入或者數量直接掛鉤的，應按規定計算繳納增值稅。納稅人取得的其他情形的財政補貼收入，不屬于增值稅應稅收入，不征收增值稅。
二、土地增值稅方面。《土地增值稅條例》第八條規定，因國家建設需要依法征用、收回的房地產免征土地增值稅。《土地增值稅暫行條例實施細則》第十一條規定，條例第八條(二)項所稱的因國家建設需要依法征用、收回的房地產，是指因城市實施規劃、國家建設的需要而被政府批準征用的房產或收回的土地使用權。因城市實施規劃、國家建設的需要而搬遷，由納稅人自行轉讓原房地產的，比照本規定免征土地增值稅。《財政部 國家稅務總局關于土地增值稅若干問題的通知》(財稅〔2006〕21號)進一步明確：因“城市實施規劃”而搬遷，是指因舊城改造或因企業污染、擾民(指產生過量廢氣、廢水、廢渣和噪音，使城市居民生活受到一定危害)，而由政府或政府有關主管部門根據已審批通過的城市規劃確定進行搬遷的情況；因“國家建設的需要”而搬遷，是指因實施國務院、省級人民政府、國務院有關部委批準的建設項目而進行搬遷的情況。
注意：符合上述免稅法規的單位和個人，須向房地產所在地稅務機關提出免稅申請，經稅務機關審核后，免予征收土地增值稅。
三、個人所得稅方面。《財政部 國家稅務總局關于城鎮房屋拆遷有關稅收政策的通知》(財稅〔2005〕45號)規定：“被拆遷人按照國家有關城鎮房屋拆遷管理辦法規定標準取得的拆遷補償款,免征個人所得稅。”個體工商戶、個人獨立或合伙企業也是個人所得稅納稅人，該文件是否包括個體工商戶、個人獨資企業和合伙企業？政策并不明確。各地口徑可能不完全一致。
在實操中，一般理解：對個體工商戶、個人獨立或合伙企業取得的非經營性補償應當免征個人所得稅，經營性補償應當按照“經營所得”計算繳納個人所得稅。如《大連市地方稅務局關于明確動遷補償收入征收個人所得稅等若干政策問題的通知》（大地稅函〔2008〕253號）和《大連市地方稅務局關于明確個人所得稅征收管理若干具體問題政策適用的通知》（大地稅函〔2009〕211號）明確：個體工商戶、個人獨資企業和合伙企業取得的政府規定標準內的動遷補償收入免征個人所得稅，超標準的部分計征個人所得稅；個人（含自然人和個體工商戶）、個人獨資企業和合伙企業因搬遷等原因取得的對生產經營收益性質的補償金，屬于經營性所得，應當按照“經營所得”項目征收個人所得稅。
安徽省稅務局的答復與大連基本是一致的：根據《財政部 國家稅務總局關于城鎮房屋拆遷有關稅收政策的通知》（財稅〔2005〕45號）文件規定，對被拆遷人按照國家有關城鎮房屋拆遷管理辦法規定的標準取得的拆遷補償款，免征個人所得稅。該“被拆遷人”包括自然人、個體工商戶、個人獨資企業和合伙企業從事生產經營活動的商業用房。但 “拆遷補償款”不包括對個體工商戶、個人獨資企業和合伙企業的經營性補償。
四、重新承受的土地、房屋免征契稅。契稅法有規定：“因土地、房屋被縣級以上人民政府征收、征用，重新承受土地、房屋權屬的，省、自治區、直轄市可以決定免征或者減征契稅。”房屋被縣級以上人民政府征收、征用，重新承受房屋權屬的契稅優惠政策，各地具體規定有所不同。以湖北省為例，《湖北省關于契稅具體適用稅率及免征減征辦法的決定》明確：因土地、房屋被縣級以上人民政府征收、征用，選擇貨幣補償且重新購置土地、房屋的，成交價格不超過貨幣補償部分免征契稅，對超出部分征收契稅；選擇房屋產權調換、土地使用權置換且不支付差價的免征契稅，支付差價的，對差價部分征收契稅。
五、印花稅方面。根據《中華人民共和國印花稅法》的規定，印花稅應稅憑證是指《印花稅稅目稅率表》列明的合同、產權轉移書據和營業賬簿。反之，未列舉的憑證就不需要繳納印花稅。拆遷補償合同不在列舉范圍內，所以，不應繳納印花稅。